A fauna do Cerrado ainda não é bem conhecida, porém muito rica e diversificada, com destaque principalmente para os insetos, que contribuem com um número de aproximadamente 65.000 espécies. Os insetos são os principais responsáveis pela biodiversidade do Cerrado, atuando como polinizadores e dispersores das espécies vegetais.
Depois dos insetos, as aves aparecem em segundo lugar em número de espécies, seguidas pelos mamíferos, répteis, anfíbios e peixes.